货物空运进口航班落地后，一般货会进入机场一级监管仓库和BGS仓库，如果订舱的时候只签发了主单，没有分单，那么最终收货人的空运进口报关代理 人就要到上面两个仓库去调空运单，这是空运进口报关文件之一。

这两个仓库如果清点货物和空运单所承运货物一致，也就是单货一致的情况下，在一个海关和监管仓库共享的系统中录入主单的舱单信息，这两个仓库都位于综合保税区内。综保区的货物在没有海关检疫放行单及电子放行信息的情况下，是无法运出综保区的。

一级监管仓库清点完货物，录完舱单信息以后，第二步是由各自指定的分拨公司将货物运至二级监管仓库，也就是空运单主单上面的收货人。二级监管仓库在清点货物后，向海关系统录入分单的舱单信息。分单显示最终收货人。

这时最终收货人的空运进口报关代理（也就是我们这类空运进口报关公司）到二级监管仓库调取空运单的分单，这时不需要主单，分单是报关文件之一，然后空运进口报关公司根据收货人提供的运单（可以是主单也可以是分单，一定是收货人显示为进口单位的运单），箱单，发票，合同及进口货物的品名，税号，其他申报要素等信息，在海关系统录入报关单，发送报关单（可在空运进口报关公司的办公室完成）。

空运进口报关单电子数据会传送到北京海关的审单中心，审单中心根据电子信息核对是否有申报错误，如果有可质疑，要求报关行解释；如果无，就会将通过的信息传送回，空运进口报关公司这个时候可以通过系统打印出报关单。

然后空运进口报关公司将报关单和其他文件一起递交到海关大厅的申报窗口，由大厅现场人员继续审核，如无误，出税单，报关行持税单到开户银行交税，也可以网上交税，交税成功后，将税单交回海关核税，核税完毕单据转放行科。如果上述几个科都没有批查货，该批货物海关就放行。

然后持海关报关申报单，到检疫进行报检，在一栋大楼内。（如果是法检商品，需要先报检后报关，持检疫的通关单才能报关）检疫如果不批查验。在报关文件的运单上会同时盖有海关和检疫的放行章，持该文件到货物所入的二级监管仓库提货，出综合保税区。完成整个流程。

注意：

①海关申报任何一个环节，海关均可以要求进行货物查验，如果批查，海关的电子查验数据会传送到二级监管仓库，二级监管仓库会将货物送到海关查验仓库，如果查验没问题，货主可以直接到海关查验仓库凭运单的放行章提货。

②检疫批查一般要在海关放行以后，持盖有海关放行章的运单到二级监管仓库自行提货，将货物运到检疫查验中心，在海关查验仓库对面，由检疫查验，无问题后可直接驶出综保区。如果有问题，检疫会扣留货物。

③海关查货一般会核查所有货物，主要是看申报是否属实，品名归类是否准确，数量是否申报有误，如果查验有问题，一般会要求提交说明，解释归类的问题，如果仍达不成统一，会退回审单中心重新归类，涉及补缴税金额过大的，有可能会转到缉私科进行处罚。

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